La creación de un tribunal interno para juzgar los crímenes cometidos durante el periodo acogido por el Acuerdo de Paz entre la guerrilla de las FARC y el Estado colombiano, ha atraído un sin número de reflexiones sobre el derecho aplicable a los conflictos armados no internacionales. Alcanzando igualmente el debate sobre la obligatoriedad de la doctrina establecida en la jurisprudencia de los tribunales ad hoc para la antigua ex Yugoslavia y Ruanda, en tanto precedente internacional de crímenes contra la humanidad y crímenes de guerra. Por ello, el artículo desarrolla un análisis de los casos más relevantes a tener en cuenta en las futuras decisiones de la Jurisdicción Especial para la Paz - JEP.