Antifungal susceptibility testing practices in mycology laboratories in France, 2018 - Aix-Marseille Université
Article Dans Une Revue Journal of Medical Mycology = Journal de Mycologie Médicale Année : 2020

Antifungal susceptibility testing practices in mycology laboratories in France, 2018

1 LCE - Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249)
2 LBBE - Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558
3 Service de parasitologie [Mondor]
4 Hôpital universitaire Bichat
5 CHU Bordeaux - Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux
6 DYNAMIC - Dynamic Microbiology - EA 7380
7 Service de Parasitologie-Mycologie
8 GQE-Le Moulon - Génétique Quantitative et Evolution - Le Moulon (Génétique Végétale)
9 CHRO - Centre Hospitalier Régional d'Orléans
10 Hôpital Universitaire de Tours
11 Hôpital Beaujon
12 CHU Caen
13 GEIHP - Groupe d'Étude des Interactions Hôte-Pathogène
14 Laboratoire de Parasitologie-Mycologie (CHU d'Angers)
15 BPF - Biologie et Pathogénicité fongiques - Fungal Biology and Pathogenicity
16 ONIRIS - École nationale vétérinaire, agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique
17 CHU Limoges
18 Hôpital Avicenne [AP-HP]
19 CHU de Poitiers [La Milétrie] - Centre hospitalier universitaire de Poitiers = Poitiers University Hospital
20 PHAR [Poitiers] - Pharmacologie des anti-infectieux
21 Centre Hospitalier de Bigorre [Tarbes]
22 Service de Parasitologie et Mycologie [CHU Toulouse]
23 UPJV - Université de Picardie Jules Verne
24 TIMC-IMAG - Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications Grenoble - UMR 5525
25 CHU Rouen
26 Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [Fort-de-France, Martinique]
27 Service de Parasitologie-Mycologie [CHRU Nancy]
28 CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
29 Service de Parasitologie-Mycologie [CHRU LIlle]
30 ECOPA - Ecologie du parasitisme - EA 3609
31 Service de Parasitologie-Mycologie [Rennes]
32 CHU Saint-Antoine [AP-HP]
33 CHU Nice - Centre Hospitalier Universitaire de Nice
34 ESCAPE - Epidémiosurveillance de protozooses à transmission alimentaire et vectorielle
35 CHU Reims - Hôpital universitaire Robert Debré [Reims]
36 MIVEGEC - Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle
37 CHRU Montpellier - Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier]
38 HIA Begin - Hôpital d'Instruction des Armées Begin [Saint-Mandé, France]
39 IICiMed - Cibles et Médicaments des Infections et de l'Immunité - EA 1155
40 Laboratoire de Parasitologie et Mycologiede [CHRU Brest]
41 HUS - Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg
42 Centre hospitalier [Valenciennes, Nord]
43 LMGE - Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement
44 Hôpital Cochin [AP-HP]
45 VITROME - Vecteurs - Infections tropicales et méditerranéennes
46 B2OA (UMR_7052) - Bioingénierie et Bioimagerie Ostéo-articulaires ; Biomécanique et Biomatériaux Ostéo-Articulaires
47 Laboratoire de parasitologie mycologie (CHU de Dijon)
48 INFINITE - Institute for Translational Research in Inflammation - U 1286
49 Hôpital Henri Mondor
50 Unité de Parasitologie-Mycologie [CHU HEGP]
C. Angebault
F. Bert
  • Fonction : Auteur
J. Bonhomme
B. Bouteille
T. Chouaki
D. Costa
  • Fonction : Auteur
J. Guillot
  • Fonction : Auteur
F. Botterel

Résumé

A survey of mycology laboratories for antifungal susceptibility testing (AFST) was undertaken in France in 2018, to better understand the difference in practices between the participating centers and to identify the difficulties they may encounter as well as eventual gaps with published standards and guidelines. The survey captured information from 45 mycology laboratories in France on how they perform AFST (number of strains tested, preferred method, technical and quality aspects, interpretation of the MIC values, reading and interpretation difficulties). Results indicated that 86% of respondents used Etest as AFST method, with a combination of one to seven antifungal agents tested. Most of the participating laboratories used similar technical parameters to perform their AFST method and a large majority used, as recommended, internal and external quality assessments. Almost all the participating mycology laboratories (98%) reported difficulties to interpret the MIC values, especially when no clinical breakpoints are available. The survey highlighted that the current AFST practices in France need homogenization, particularly for MIC reading and interpretation.
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Dates et versions

hal-02566987 , version 1 (11-05-2020)

Identifiants

Citer

A.-P. Bellanger, F. Persat, F. Foulet, C. Bonnal, I. Accoceberry, et al.. Antifungal susceptibility testing practices in mycology laboratories in France, 2018. Journal of Medical Mycology = Journal de Mycologie Médicale, 2020, 30 (2), pp.100970. ⟨10.1016/j.mycmed.2020.100970⟩. ⟨hal-02566987⟩
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